Del 3 al 7 de agosto de 2026
E N. C O N S T R U C C I Ó N. 2026
Formato de talleres: virtuales
Cada participante deberá trabajar con su propia computadora, preferentemente con sistema operativo Linux ó Mac OSX . Si tienes instalado sistema operativo Windows, deberás instalar: WSL (https://learn.microsoft.com/enus/windows/wsl/install).
A los inscritos se les enviara el enlace para ingresar a las sesiones de trabajo vía la plataforma ZOOM.
Principiantes. Descargar programa taller Principiantes
Coordinadores: Dr. Alexander Pérez de la Luz, Universidad Autónoma Metropolitana, correo: (This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.; This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.; This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.); Dra. Gloria Arlette Méndez Maldonado, Universidad de Guadalajara, correo: (This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.)
Objetivo: Promover la formación y el uso de herramientas de Dinámica Molecular atomística mediante el aprendizaje y la aplicación de programas paralelos entre la comunidad científica mexicana. Durante el taller se abordarán los fundamentos teóricos y prácticos necesarios para el uso confiable y eficiente de los paquetes de simulación LAMMPS y GROMACS. Asimismo, se realizarán sesiones prácticas enfocadas en el cálculo y análisis de propiedades fisicoquímicas mediante Grace, así como en la visualización y exploración de trayectorias utilizando VMD.
Contenido general: El taller de principiantes estará dividido en 9 cursos del 3 al 7 de agosto de 2026:
- Linux
- Mecánica Estadística
- Método de Monte Carlo
- Dinámica Molecular
- Scripts y Grace
- VMD
- GROMACS
- LAMMPS
- Python
Requisitos: Maquina con Linux y tener instalado los siguientes programas VMD, LAMMPS y GROMACS, además del graficador XMGRACE.
Modalidad del curso: Online vía ZOOM
Campos de Fuerza. Descargar programa taller Campos de Fuerza
Coordinadores: Dr. Edgar Omar Castrejón González (ITCelaya) This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.; Dr. Edgar Núñez Rojas (SECIHTI - UAM-Iztapalapa) This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
Objetivo: Usar los programas GROMACS y LAMMPS de Dinámica Molecular en diversas aplicaciones. Revisar las limitaciones de los campos de fuerza OPLS/AA, CHARMM y TraPPE-UA. También, aplicar nuevas estrategias (desarrollados por los investigadores que imparten el curso) para mejorarlos.
Contenido General: El curso incluye aplicaciones a líquidos, al equilibrio líquido-vapor y líquido-líquido, así como a sus interfases. Se obtienen propiedades usadas en el proceso de parametrización tales como distribuciones de carga, densidad para líquidos, entalpía de vaporización, constante dieléctrica, tensión superficial, propiedades críticas, energía libre de solvatación y solubilidad, entre otras. Los sistemas incluyen fluidos polares y nopolares, líquidos iónicos, surfactantes y polímeros. Al finalizar habrá una sesión de visualización de datos para presentar gráficas profesionales usando Phyton.
Requisitos: El curso está dirigido a usuarios de programas de dinámica molecular (GROMACS, DL_POLY, NAMD o LAMMPS) con conocimientos básicos de mecánica clásica, química cuántica y termodinámica estadística. Los interesados deberán disponer de tiempo completo para el curso. Los participantes deberán disponer de una computadora personal con sistema operativo (o máquina virtual) con Linux. Los programas que deben tener instalados antes del inicio del curso son VMD, OVITO, GROMACS, LAMMPS, XMGRACE, FORTRAN y PYTHON.
Modalidad del curso: Online vía ZOOM
Dinámica Browniana
Coordinador: ...
Objetivo: ...
Requisitos: ...
Modalidad del curso: ...
Dinámica Molecular Asistida por Inteligencia Artificial. Descargar programa completo
Coordinador: Dr. José Alejandre Ramírez, Universidad Autónoma Metropolitana; correo: (This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.)
Objetivo: Enseñar los conceptos básicos y algunas aplicaciones de la dinámica molecular utilizando herramientas de inteligencia artificial (IA) como apoyo en el aprendizaje y en la resolución de problemas científicos.
Contenido General:
El taller estará dividido en 11 cursos del 3 al 7 de agosto de 2026:
Temas:
1. Conferencia de simulación molecular diaria impartida por investigadores
2. Ecuaciones de movimiento de Newton
3. Fundamentos de dinámica molecular, termostatos y baróstatos
4. Dinámica molecular de líquidos y del equilibrio líquido/vapor usando GROMACS
5. Dinámica mesoscópica bicapa/agua y plegamiento de proteínas usando DL_MESO
6. Optimización bayesiana en dinámica molecular y su aplicación para obtener energía
Libre
Requisitos: Conocimientos básicos de las leyes de Newton, de dinámica molecular, de campos de fuerza, de mecánica estadística, de probabilidad y estadística y de python. Uso de Linux, manejo de terminal, uso de editores de texto como Vim o Vi y conocimiento básico de bash.
Modalidad del curso: Online vía ZOOM
Métodos QM/MM/MD
Coordinadores: ...
Objetivo: ...
Contenido General: ...
Requisitos: ...
Modalidad del curso: ...
Molecular Dynamics Workshop Facebook Group
ENLACES PARA INSTALAR PROGRAMAS A UTILIZAR EN LOS TALLERES
